Zgodnie z art. 95 pkt. 3 ustawy z dnia 16 kwietnia 2004 roku o ochronie przyrody przy dyrektorze parku narodowego działa rada naukowa, będąca organem opiniodawczo-doradczym w zakresie ochrony przyrody.

Członków rady naukowej parku narodowego, zgodnie z art. 98 ust. 1 ww. ustawy, powołuje w liczbie od 10 do 20 na kadencję trwającą 5 lat, minister właściwy do spraw środowiska w drodze zarządzenia.

Rada Naukowa Parku Narodowego „Bory Tucholskie" została powołana Zarządzeniem Nr 75 Ministra Środowiska z dnia 25 listopada 2009 roku pobierz

Przewodniczącym Rady jest prof. dr hab. Kazimierz Tobolski z Instytutu Geoekologii i Geoinformacji Uniwersytetu Adama Mickiewicza w Poznaniu. Stanowisko zastępcy przewodniczącego sprawuje prof. dr hab. Józef Szmeja z Katedry Ekologii Roślin Uniwersytetu Gdańskiego. Członkiem prezydium jest również prof. dr hab. Maria Ławrynowicz z Katedry Algologii i Mikologii Uniwersytetu Łódzkiego.